Em 1991, a partir da estadualização da Faculdade de Engenharia Química de Lorena (FAENQUIL), houve a criação do Centro Básico (LOB), inicialmente  voltado ao atendimento das demandas de ensino de Cálculo e Física pertencentes ao núcleo básico das engenharias, além de algumas das disciplinas profissionalizantes, como Psicologia, Direito, Português, Tubulações Industriais, Organização Industrial e Segurança do Trabalho. Estas disciplinas eram parte das grades dos cursos de graduação em Engenharia Química, Engenharia Industrial Química, Engenharia Bioquímica e Engenharia de Materiais.

Em maio de 2006, a FAENQUIL foi incorporada pela Universidade de São Paulo (USP), tornando-se a Escola de Engenharia de Lorena (EEL). Para tal incorporação, houve um acordo  estabelecido com a SCTDE, em que é assegurada a condição de continuidade dos cursos desenvolvidos pela extinta FAENQUIL  na condição de EEL/USP (Decreto nº 50.839, de 29/05/2006). 

Em 10/07/2021, um Termo Aditivo renovou o convênio por mais 60 meses, “assegurando a colaboração institucional a fim de dar continuidade e desenvolvimento dos cursos e atividades transferidas à USP”. Com este convênio, os docentes da FAENQUIL na época, passaram a ministrar as aulas da EEL, assim como os servidores técnicos administrativos continuaram a exercer suas funções.  

Em 2009, a partir do Centro Básico, foi criado o Departamento de Ciências Básicas e Ambientais (DEBAS), com a finalidade de continuar com a responsabilidade de administrar as disciplinas do Ciclo Básico e implementar o curso de Engenharia Ambiental. 

Em 2011, o Conselho Universitário da USP aprovou a criação do curso de Engenharia Ambiental, com 40 vagas em período integral e duração de 10 semestres. Dessa forma, além da responsabilidade pela grade curricular de todo o Ciclo Básico que atende todos os cursos de engenharia da Instituição, os docentes passaram a ter uma nova área de atuação e a constituir grupos para desenvolver estudos e pesquisas também na área ambiental. Em 2012 o curso entrou em funcionamento, assim como os cursos de Engenharia de Produção e de Engenharia Física, os quais não estão lotados no DEBAS, mas tem em seu ciclo básico as disciplinas do departamento.